邓显鹤从18岁起即编诗集,39岁时,已有《种草堂初集》、《相思草》、《北上集》、《观海集》、《过江》上、下集等14种,约8000馀首。嘉庆二十三年,诗稿毁于火。后静心追忆,又经欧阳辂删辑,仅存300馀首,编为《湘皋诗存》5卷。后又成《南村草堂诗钞》24卷、《南村草堂文钞》20卷。陶澍以为:“湘皋之诗,导源于魏晋,而驰骋于唐宋诸老之场。雄厚峻洁,磅礴沉郁,情深而意远,气盛而才大。”其文钞,鄞人沈道宽比之全祖望《鲒埼亭集》。
数十年中,勤于问献考订编纂,用心收集前人诗文,以集成《资江耆旧集》60卷、《沅湘耆旧集》200卷;《沅湘耆旧集续编》100卷、《沅湘耆旧集小传》20卷和《资江耆旧集小传》4卷。
重刊明代周圣楷《楚宝》,并加增益考订,刊成《楚宝增辑考异》40卷、《外篇》5卷,时人以为是书:“去取详慎,于地理废置沿革,尤多辨晰,所论断皆有依据,足补前书所未及。”
与邹汉勋校勘王夫之的遗书经部38种计180卷,刊行于世。考订周敦颐《周子全书》9卷、《首录》2卷,编校元欧阳玄《圭斋集》18卷。还著有道光《宝庆府志》157卷、嘉庆《武冈州志》34卷、《邵州先民录》等10余种传世。
邓显鹤最为之花费心血,对后世影响最大的,是他对湖南地方文献的整理。《清史稿》说他“以纂述为事,心系楚南文献者三十年。”易宗夔说他“搜讨掌故,不遗余力”、“岿然称楚南文献者,垂三十年云。”商务印书馆出版的《中国人名大辞典》说他“以搜讨乡邦掌故为已任,一意表彰先哲。”曾国藩说他“其于湖南文献,搜讨尤勤,如饥渴之于食饮,如有大谴随其后驱迫而为之者”、“全省之方舆略备,巨制零章,甑采略尽。”(《表墓》)
在整理的文献中对后世影响最大的是《船山遗书》的刊刻。因此晚清著名经学家王先谦由衷地赞赏:“今者船山先生竟与顾、黄两先生共垂不朽,刊书之功不可没。” 于是经过艰苦的搜集,邓显鹤共整理《船山遗书》一百五十卷,于道光十九年在长沙开雕。不料,咸丰四年,由于太平军攻陷湘潭,“板竟毁于火”。湘皋先生对之汲汲不忘,多次寄书寄诗曾国藩曾国荃兄弟,督其印书。同治二年,曾国荃在先生所搜集整理的基础上又“增益百七十二卷”,“海内学者始得见其全书焉”。(以上事见《清史稿·儒林传》、曾国藩《王船山遗书序》)。王船山提倡的“尽天地只是个诚”的“实学”,对于湖湘学人“经世致用”学风的影响是决定性的,是湘学勃兴的理论基础。而没有邓氏的努力,天下学子竟不得以窥船山学问的全貌。因此,有人称湘皋先生为“湘学复兴大师”。